Родился в 1972 г. в п. Каменоломни Ростовской обл. В 1994 г. окончил Новочеркасский государственный технический университет и получил квалификацию горного инженера-строителя. В 1998 г. защитил кандидатскую, в 2009 г. – докторскую диссертации. В 2011 г. получил ученое звание профессора по кафедре подземного, промышленного, гражданского строительства и строительных материалов.
Работал в должностях лаборанта, ассистента, ст. преподавателя, доцента, начальника отдела управления НИР, зам. директора по научной работе и образовательной деятельности, профессора, зав. кафедрой, ведущего эксперта, ведущего специалиста, главного инженера проектов.
Член диссертационных советов Д.24.2.297.02 и Д24.2.297.03 при ДГТУ.
Под руководством А.Ю. Прокопова защищены 7 кандидатских диссертаций.
С 2014 г. привлеченный эксперт ГАУ РО "Государственная экспертиза проектов"
С 2022 г. член экспертного совета ВАК по наукам о Земле при Минобрнауки России.
Руководитель ОПОП магистратуры 08.04.01 «Промышленное и гражданское строительство».
Судебный эксперт в области исследований строительных объектов, проектной документации и др.
Активно участвует в развитии международной деятельности ДГТУ. В 2023-24 гг. работал приглашенным профессором в Шаньдунском транспортном университете (г. Цзинань, КНР).
Награжден серебряной медалью Китайской международной выставки научных достижений (г. Шэньян, КНР, 2006 г.), Почетной грамотой Минобрнауки России (2008 г.); Благодарностью ЗС РО (2008 г.); Межотраслевым знаком «Горняцкая слава» II степени (2008 г.); Нагрудным знаком «Шахтерская доблесть» III степени (2008 г.); Высшим знаком отличия ШИ ЮРГТУ(НПИ) «Серебряное перо» (2009 г.); Дипломом Минобрнауки России (2010 г.); званием «Почетный работник высшего профессионального образования РФ» (2016 г.); Грамотой Союза работодателей РО (регионального отделения РСПП) (2019 г.); победитель конкурса в номинации «Профессор года Дона - 2022» Ростовской областной организации общероссийского профсоюза образования (2022 г.).